V súčasnosti prebieha vyhodnocovanie financií na FPU. Odborná komisia, ktorá v súčasnosti funguje ako poradný orgán, predložila svoje návrhy rade k ďalšiemu hlasovaniu. Hlasovaniu predchádza rozprava členov rady a obhajoba návrhov predložených do hlasovania.
Odborná komisia postupovala v súlade s platnými internými predpismi, ktoré však obmedzujú finančné hodnotenie a schvaľovanie financií rade. Rada už v minulosti na daný predpis upozornila FPU a pripravuje jeho úpravu a zosúladenie s platným zákonom o FPU.
Zosúladenie umožní dávať projektom viac financií, nie stanovený rámec FPU alebo 0. To znamená, že niektoré projekty mali už komisiou určenú minimálnu sumu, ktorú im rada mala prideliť a hlasovanie rady bolo obmedzené možnosťou rozhodnúť o pridelení nižšej sumy.
Rada mala možnosť prideliť len stanovenú minimálnu sumu komisiou alebo nič. To prinášalo na konanie rady negatívny pohľad verejnosti. A to práve už obmedzenou možnosťou postupovať v zmysle zákona.
Komisia vo všeobecnosti obhajovala projekty, ktoré poznala, čo navodzovalo dojem, že niektorí členovia priamo participujú na projektoch. Napr. v oblasti tanec komisia obhajovala jednotlivé projekty, pričom rada čakala obhajobu spôsobu, akým rada daným projektom pridelila financie. Prečo by mal daný projekt dostať financie. Komisia uvádzala často fakty, ktoré neboli uvedené v popise projektov.
Rovnaká obhajoba bola aj v prípade nadácie Milana Šimečku, ktorej komisia navrhovala financie a Rada naopak zamietla.
Rozpor nastal v prípade, keď členovia rady upozornili na to, že po ukončení zasadnutia komisie, odišli dvaja členovia a odborná komisia pokračovala v navyšovaní financií práve pre nadáciu Milana Šimečku.
